Что делать с документами?

Позвоните тогда в школу, скажите, что уже внесли данные. Возможно, они сами их ещё не забили. Вы подаете или лично, или электронно. Это сделано для удобства тех, у кого нет возможности подать электронно. А не для того, чтобы и там, и там подавали. Когда вы приносите документы в школу, работникам приходиться самостоятельно забивать ваши данные в систему, это лишняя работа для них, поэтому если вы уже внесли данные позвоните и скажите, что вы уже подали, чтобы не делать двойную работу им. А документы вы приносите в школу только после того, как вам пришло приглашение о зачислении. Вы изучите внимательно вопрос, прежде, чем делать.

Секретарю школы позвоните, у нас она занимается. В приемную директора.

А заявление зачем подавали на гос услугах? Если принесли доки в школу там и нужно было писать.