Я с дочкой делала так:
рисовали страх на альбомом листе,все что беспокоит. Сминали его в комок. На большой тарелке дочь сжигала. Приговаривая что то типа "уходи,я тебя не боюсь". Любые удобные ей слова. И спускался пепел в унитаз.
Ну и пока не забудется,ночник в сон,присутствие и поддержка родителей.

Я бы перед сном проверяла бы комнату, типа маленький ритуал ) что никого нет )

Продолжать так же успокаивать, не наставить на сне без света.
А вообще, если у вас дочка уже знает анатомию, мозг, то можно объяснить всё что ей видится с научной точки зрения, что это просто игры мозга, он так заменяет информацию, глаза не видят а мозг додумывает за них, так же и про звуки. Не знаю насколько это поможет, но моему ребёнку лучше объяснять именно так, раз так объяснила и ему стало вроде как понятно, перестал боятся темноты)