Д3 только утром. Усваивается с жирами. Поэтому вместе с омегой можно. Фолиевая и йод без разницы по времени. Фолиевую во время еды, йод - после. Чтобы все вместе не пить, можете фолиевую и йод в обед, например.
Если магний еще есть/будет, то его во время ужина или перед сном (смотря какой)
Если готовый комплекс какой-то, то чаще во время завтрака, но уточняйте на упаковке

Йод после еды