С этого года медучреждения могут эти справки передавать в налоговую самостоятельно, но заявление на получение такой справки вы должны написать, обратившись в бухгалтерию клиники.
Я бы рекомендовала вам позвонить в бухгалтерию и уточнить, может быть можно и электронным образом отправить им его, думаю зависит от бухгалтера.