Я выбираю обувь из натуральной кожи: она через пару носок растягивается по ноге и не натирает, хотя у меня есть косточка на пальце и повышенные требования к задникам и своду стопы.
Если обувь без поддержки свода, докупаю специальные гелевые вкладыши на липкой основе. Такие же есть и для пальчиков, и для задников.
И босоножки никогда не беру с тонкими перепонками на пальцах.

Проверьте длину стопы может вы не правильно подбираете размер?