Смотря на каких зубах у малышки кариес. Если на жевательных - то скорее всего не поможет, потому что они долго меняются и кариес все равно возьмет свое. Если на передних зубах - то вполне себе может продержаться до смены, без разрастания.
Если вопрос стоит вообще фторировать или просто оставить как есть - то конечно фторировать.