Ну если на отдых, то отменила бы, потому что неизвестно сколько может проболеть. Если куда-то в гости, на долго, то поехала бы. Ещё конечно смотря какие симптомы, если нет жидкого стула, рвоты, то вполне можно и в поезде так же дать жаропонижающее и закапать в нос.
Ещё наверное зависит в купе или плацкарт.