Пока платите исправно, нет споров и не намного меньше, чем в прошлые месяца, то никто к вам не привяжется.

Да, аннулируйте и создайте чек на нужную сумму

Ну, режим самозанятости не предполагает вычета расходов, поэтому теоретически так делать нельзя, но учитывая, что вы в принципе показываете только те доходы, что хотите, вряд ли кто-то будет вникать в эти мелочи и вас как-то за это преследовать

Да, вы сами формируете свои чеки, как вам угодно