Можно сколько угодно школ выбрать, но на каждую нужно отдельное заявление подавать. С 1 апреля - в школы на закрепленной территории, по прописке/регистрации. А с 6 июля - в любые, на оставшиеся места (если они остались, конечно). 3 школы в одном заявлении - это раньше так было. Уже 2 года другая система.