Сами можете высчитать минимальные доли пропорционально мат.капиталу (либо сколько считаете нужным, но всё же советую минимальные) и подать соглашение о выделе доли в МФЦ. Образец найдите в интернете.
Можно и у нотариуса, но отдадите не мало денег.

Соглашение составили на каждого члена семьи, нужны паспорта, свид о рождении и в МФЦ гос пошлину оплатили.

Мы выделяли у нотариуса, договор на квартиру, выписку из выплатной дела брали в пенсионном, паспорта, свидетельство о браке,о рождении детей, снилсы…егрн на квартиру , вроде все