Никакой , если применяются по назначению и подобраны верно. Впрочем это касается любых лекарств и витаминов. Для нормализации микрофлоры, о чем пишут выше, нужно пить, есть кисломолочные продукты, овощи.
Помимо вреда для микрофлоры а/б создают нагрузку на печень. Поэтому пить их надо, когда врач прописал. Но и бояться как огня тоже не стоит, иногда без них не обойтись