Плохо девочке 2 месяца, что делать? К врачу только в воскресенье!

При пиелонефрите лейкоцитов гораздо больше.температура выше 39.

Ну лейкоцитов многовато конечно, но эпителия почечного нет, значит скорее не почки, а ниже проблема (если есть). Нужно пересдать ещё раз, чтобы убедиться. Ребенок маленький, порция скорее всего была не средняя, плоский эпителий может быть с этим связан. Эритроциты в норме. Фосфаты от питания зависят плюс у вас рН высоковат что способствует их появлению. Явление может быть разовым.