Могли мазок ещё взять неправильно, пересдайте через пару недель
У меня так например было, вставала на учёт был плохой мазок, но не пила ничего и не вставляла, пересдала «типа после лечения» и мазок пришёл стерильный

Был у меня этот стрептококк, пропила антибиотик, пересдала через 2 неделе, все чисто. Я консультировалась с двумя гинекологами и мне сказали пить, тем более назначают такой антибиотик, который разрешён при беременности. А в родах не всегда есть возможность прокапать антибиотик, роды бывают стремительные. Так что проконсультируйтесь еще.