Можете. У нас ипотеку брал муж, мат.капитал в первоначальный взнос. Вы когда будете подавать на распоряжение, там есть графа, что ипотека оформлена на другого человека.
Мы вкладывали в квартиру мужа, никаких проблем не было. Он там был один собственник. Но после погашения ипотеки выделяются доли матери и всем её детям в квартире на которую был потрачен маткапитал.