Может это просто акне новорожденных? Очень похоже. Это когда гормоны ваши из малыша выходят! Его организм полностью заработал самостоятельно и немного уже адаптировался.
У меня у 2 дочки так было и питание здесь не причём. Оно пройдёт самостоятельно к 3-4 месяцам. Ничего с ним делать не нужно. Можно уточнить у педиатра!