В законодательстве РФ нет прямого указания о присвоении двойного отчества. Поэтому в случаях двойного имени у отца, опираясь на семейное законодательство, отчество дается ребенку по соглашению родителей от любого из двух имен либо сразу из обоих.

Т.е. если муж Иван-Петр, то ребенок может быть записан:

А) Иванович

Б) Петрович

В) Иван-Петрович

Любой из вариантов считается верным.

А вот Петр-Иванович записано быть не может, так как имена местами менять нельзя.

странно конечно,мне кажется изначально должны были написать как по имени мужа,через дефис.

а теперь из-за их "никаких проблем " у вас проблемы.

Всегда все как в документе первоисточнике,вопросы и дальше будут,на мой взгляд нужно исправлять свидетельство