Мы ездили 1000 км, 12 часов и в купе и в плацкарте. Разницы для детей никакой, нам родителям комфортнее в купе было, но мы выкупали все 4 места. Но в следующий раз поедем точно в плацкарте.
Вам 5 часов с нижними полками тоже уверена нормально будет в плацкарте.