По менструации (первый день последних месячных) - акушерский срок, по размерам плодного яйца - эмбриональный (грубо говоря считается от овуляции). Разница между первым днём последних месячных и овуляцией и есть примерно две недели +/-. Поэтому у вас всё прекрасно, можно радоваться.