Смотря какая температура. Головная боль может быть при гриппе, но тогда боль в животе тут сомнительна. Врач должен по симптомам определить болезнь, и обязательно надо сдать анализы.
При менингите высокая температура сочетается с головной болью и болями в животе, но там головная боль дико невыносимая. Также доходит до обмороков, человек чувствителен к свету и имеется еще пара явных симптомов. В голову это не берите и не паникуйте, эта информация лишь для сведения.

Я бы обратилась к врачу. У нас тоже как-то дочь на головную боль жаловалась, обращались. В норме у детей головные боли не должны быть.