В двух больницах точно не получится. Выдаётся только одно направление в определённую.
И на сколько я знаю с декабря того года новый порядок. Врач сам создаёт заявку на госпитализацию, больницы откликаются, если готовы Вас принять. И вы уже из этого списка выбираете одну, а далее врач выдаёт электронное направление.