Налоговый вычет это и есть подоходный налог 13%который у вас удержали при начислении ЗП. Так вот при расчете пособий считается вашей зарплатой вся начисленная ЗП, а не та, что вы получили на руки. Соответственно вычет который вам вернули не будет считаться доходом