Возбудителями болезни являются бактерии, вирусы и грибки (рода Candida). Например, вирус герпеса, который, к слову, часто становится причиной не только глоссита, но и стоматита. Стрептококки и стафилококки также нередко вызывают воспаление языка.
Причины появления географического языка недостаточно изучены, но отмечена связь с инфекционными заболеваниями, аллергией, болезнями органов желудочно-кишечного тракта, печени, поджелудочной железы, эндокринными нарушениями (возникает у женщин в постменопаузе) и нарушениями обмена веществ, аутоиммунными заболеваниями.