По анализу крови узнать.
Плюс симптоматика.
Если бактерия, то антибиотики и действуют они не сразу, у них накопительный эффект. Только на 3и сутки приема температура начнет нормализоваться. Это при условии, что антибиотик подошел. А бывает, что нет и приходится менять, и снова ждать.
Если нет идите сдавайте кровь.