Патогенные бактерии живут в нашем организме всегда. С рождения. С ними борются : 1- наш иммунитет; 2- полезные бактерии нашего организма.

Когда иммунитет занят борьбой с вирусной инфекцией или ослаблен после тяжёлой болезни/операции/хронической болячки/неблагоприятных условий - патогенная флора начинает безпрепятственно размножаться.

2- частое необоснованное применение аб и антибактериальных препаратов убивает полезную флору, что опять-таки позволяет развиваться патогенной.

Что бы избегать - здоровый образ жизни (питание, сон, отдых, режим дня), после тяжёлой болезни дать восстановительный период. В период вирусной инфекции не допускать застоя слизи в лёгких, бронхах, носоглотке, так как слизь - лучшая среда, для развития бактерий. Для это пить почаще, увлажнять воздух, при необходимости по согласованию с врачом ингаляции.

Ну и есть изначально бактериальные инфекции. Их в любом случае аб лечить, они не присоединившиеся.