Если работник выполняет дополнительную работу в порядке совмещения, то отпуск предоставляется только по основной должности. Если же речь идет о внутреннем совместительстве (на основании второго трудового договора), то отпуск рассчитывается и предоставляется отдельно по каждой должности.

28 дней положены за полный год.

Если отработано меньше, то и срок отпуска будет меньше. По-крайней мере у нас так, можете уточнить в своей организации.