Если в ипотеку вложен МК, доли выделять обязательно, вне зависимости на вас или на мужа оформлена ипотека. После оформления сертификата МК нужно оформить соглашение у нотариуса о том, что после погашения ипотеки вы обязуетесь выделить доли на жену-мужа-детей, после этого с пакетом документов в мфц и пфр перечислит деньги в банк. Доли могут быть пропорционально вложенному МК или равные на членов семьи.