Если вас лечат от дисбактериоза тем что выписали, то это какая-то шляпа. Скину в ЛС ссылку, почитайте там может будет вам проще потом доктора адекватного подобрать..

А что лечит то гастроэнтеролог? Какие жалобы?

Креон тоже может давать сыпь из-за слабых слизистых оболочек желудка и кишечника. Креон с едой давали?
Я бы ещё задала вопрос по кислой моче, так как нормы кислотности должны быть выше. И слизь по копрограмме даёт какой-то воспалительный процесс, т.к. эозинофилы в норме, то возможно бактерии: клебсиела и стафилококк. Странно, что вам не назначили что-то для их лечения. Я бы сходила к другому врачу. Здоровья малышу!