Это из-за зубов возможно. Наш тоже так делал, когда зубы прорезывались первые. Болит десна, а он не знает ещё как определить где болит и трогает ушки, так как до них достает.
У нас так делает, дёргает иногда и почти всегда после сна, но думаю это просто так ему интересно или удобно ручками за ушки цепляться. Точно знаю что уши у него не болят.