Мы когда прописывали ребеночка мужу в мфц сказали мать должна тк вы там не прописаны, хотя он тоже собственник квартиры. Скорее всего это нужно сделать отцу. Либо вместе идти, один пишет заявление о выписке, другой о прописке. Позвоните в мфц вам подскажут как сделать.